Pendant plus de 20 ans, deux regroupements d’agents de protection de la faune ont existé au Québec : la section québécoise de l’Union internationale des gardes professionnels de la faune et l’Association des gardes-chasse de l’Estrie. Voulant unir leurs efforts puisqu’ils partageaient des objectifs communs, ces deux organisations ont fusionné en 2002 et c’est ainsi qu’est née l’Association des agents de protection de la faune du Québec.
L’AAPFQ regroupe présentement plus de 120 membres, principalement des agents de protection de la faune en fonction, des agents retraités et des employés civils de Faune Québec. Formée d’un conseil d’administration central, l’AAPFQ englobe des regroupements régionaux ayant pour but de faciliter la participation des membres dans leur région respective.